MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012580	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012580	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012580	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012580	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012580	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012580	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012580	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012580	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012580	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012580	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012580	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012580	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012580	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012580	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012580	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012580	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012580	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012580	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012580	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012580	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012580	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012580	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012580	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012580	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
26	NC_012580	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811636
27	NC_012580	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	227811636
28	NC_012580	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
29	NC_012580	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
30	NC_012580	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
31	NC_012580	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	227811636
32	NC_012580	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	227811636
33	NC_012580	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227811636
34	NC_012580	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	227811636
35	NC_012580	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	227811636
36	NC_012580	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
37	NC_012580	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
38	NC_012580	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
39	NC_012580	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	227811636
40	NC_012580	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
41	NC_012580	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
42	NC_012580	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
43	NC_012580	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811636
44	NC_012580	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	227811636
45	NC_012580	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	227811636
46	NC_012580	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	227811636
47	NC_012580	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	227811636
48	NC_012580	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811636
49	NC_012580	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
50	NC_012580	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
51	NC_012580	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
52	NC_012580	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
53	NC_012580	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	227811636
54	NC_012580	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	227811636
55	NC_012580	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811636
56	NC_012580	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	227811636
57	NC_012580	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811636
58	NC_012580	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
59	NC_012580	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
60	NC_012580	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
61	NC_012580	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
62	NC_012580	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	227811636
63	NC_012580	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
64	NC_012580	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
65	NC_012580	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	227811636
66	NC_012580	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	227811636
67	NC_012580	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012580	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012580	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012580	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012580	T	7	7	3279	3285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012580	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
73	NC_012580	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
74	NC_012580	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	227811637
75	NC_012580	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811637
76	NC_012580	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
77	NC_012580	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	227811637
78	NC_012580	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
79	NC_012580	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
80	NC_012580	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	227811637
81	NC_012580	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	227811637
82	NC_012580	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
83	NC_012580	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	227811637
84	NC_012580	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012580	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811638
86	NC_012580	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
87	NC_012580	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811638
88	NC_012580	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
89	NC_012580	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811638
90	NC_012580	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012580	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	475645757
92	NC_012580	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	475645757
93	NC_012580	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645757
94	NC_012580	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	475645757
95	NC_012580	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012580	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012580	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
98	NC_012580	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811640
99	NC_012580	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	227811640
100	NC_012580	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	227811640
101	NC_012580	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811640
102	NC_012580	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	227811640
103	NC_012580	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	227811640
104	NC_012580	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
105	NC_012580	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
106	NC_012580	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
107	NC_012580	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	227811640
108	NC_012580	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811640
109	NC_012580	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811640
110	NC_012580	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811640
111	NC_012580	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811640
112	NC_012580	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
113	NC_012580	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
114	NC_012580	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	475645758
115	NC_012580	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645758
116	NC_012580	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
117	NC_012580	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	475645758
118	NC_012580	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
119	NC_012580	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	475645758
120	NC_012580	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	475645758
121	NC_012580	GTCT	2	8	6195	6202	0 %	50 %	25 %	25 %	475645758
122	NC_012580	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
123	NC_012580	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	475645758
124	NC_012580	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	475645758
125	NC_012580	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	475645758
126	NC_012580	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
127	NC_012580	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645758
128	NC_012580	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012580	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
130	NC_012580	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
131	NC_012580	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	227811642
132	NC_012580	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
133	NC_012580	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	227811642
134	NC_012580	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
135	NC_012580	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	227811642
136	NC_012580	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
137	NC_012580	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	227811642
138	NC_012580	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
139	NC_012580	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811642
140	NC_012580	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
141	NC_012580	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
142	NC_012580	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	227811642
143	NC_012580	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	227811642
144	NC_012580	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
145	NC_012580	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811642
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147	NC_012580	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
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149	NC_012580	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
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151	NC_012580	GC	3	6	7542	7547	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
152	NC_012580	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
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157	NC_012580	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
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162	NC_012580	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
163	NC_012580	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
164	NC_012580	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
165	NC_012580	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	227811642
166	NC_012580	GTT	2	6	8306	8311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012580	AGCGGT	2	12	8329	8340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_012580	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012580	TAA	2	6	8451	8456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012580	AGTG	2	8	8483	8490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012580	AG	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012580	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645759
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174	NC_012580	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
175	NC_012580	TC	3	6	8773	8778	0 %	50 %	0 %	50 %	475645759
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239	NC_012580	AATC	2	8	11897	11904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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241	NC_012580	ATT	2	6	11972	11977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_012580	GGT	2	6	12059	12064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_012580	TCAC	2	8	12118	12125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
244	NC_012580	CTC	3	9	12155	12163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
245	NC_012580	ATG	2	6	12168	12173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_012580	GGA	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_012580	GTT	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811645
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265	NC_012580	ACCA	2	8	13331	13338	50 %	0 %	0 %	50 %	227811645
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268	NC_012580	CTG	2	6	13391	13396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811645
269	NC_012580	ACC	2	6	13428	13433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811645
270	NC_012580	CAA	2	6	13442	13447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811645
271	NC_012580	GTGC	2	8	13448	13455	0 %	25 %	50 %	25 %	227811645
272	NC_012580	ATC	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811645
273	NC_012580	GAA	2	6	13502	13507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
274	NC_012580	TG	4	8	13539	13546	0 %	50 %	50 %	0 %	227811645
275	NC_012580	GCG	2	6	13574	13579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811645
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277	NC_012580	GCTG	2	8	13677	13684	0 %	25 %	50 %	25 %	227811645
278	NC_012580	AGA	2	6	13722	13727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
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280	NC_012580	CAA	2	6	13828	13833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811645
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285	NC_012580	ATC	2	6	14063	14068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811645
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290	NC_012580	GAA	2	6	14309	14314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
291	NC_012580	ACA	2	6	14325	14330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811645
292	NC_012580	CTC	2	6	14417	14422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811645
293	NC_012580	CTG	2	6	14438	14443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811645
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296	NC_012580	T	6	6	14745	14750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_012580	GA	3	6	14787	14792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
298	NC_012580	CGAT	2	8	14846	14853	25 %	25 %	25 %	25 %	227811646
299	NC_012580	GAC	2	6	14889	14894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811646
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305	NC_012580	TGG	2	6	14986	14991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811646
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343	NC_012580	CAA	2	6	17212	17217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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379	NC_012580	T	7	7	19463	19469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_012580	T	6	6	19614	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_012580	TCAT	2	8	19724	19731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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386	NC_012580	AGATG	2	10	19873	19882	40 %	20 %	40 %	0 %	227811648
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393	NC_012580	TGA	2	6	20254	20259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811648
394	NC_012580	GGC	2	6	20319	20324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_012580	GGAA	2	8	20397	20404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
396	NC_012580	TGG	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811649
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